芦花鸡鸡苗的运输过程很重要：（1）装盒待运。专用雏盒常用瓦楞纸制成，一般每盒可装100羽鸡苗，长途运输或夏季运输时，每盒装80羽鸡苗。码放时，每行间要留出空隙，保证空气流通。（2）运雏车内应备有温度计，确保运输过程中有效调控温度。（3）运输车辆在装鸡苗前要消毒。车底和盒底喷洒消毒，其它部位喷雾消毒，消毒剂可选择无刺激性药物如抗毒威、百毒杀等。运输车辆最好为专用运雏车辆或带有空调设备的客运车。 （4）运输人员在行车前应向鸡苗生产单位索要《畜禽及其产品运输检疫证明》。 （5）同一车辆（飞机）严禁运输不同品种的畜禽。 （6）运输过程中，冬季车内温度控制在２８℃为宜（由于鸡苗装在雏鸡盒内密度大，局部产热高，因而身体感受温度要比温度计所测到的高３－４℃以上），开车通风时，严禁将风吹到鸡体上；夏季经常开窗通风并在地面适当洒些水。条件许可时，应定时调换装鸡盒位置。（7）雏鸡装车越快越好。夏季因特殊情况需停车时，车应停放在阴凉处并通风降温，防止鸡脱水死亡。无论运输距离多远，出壳后应在３６小时内运到，超过４８小时就会有不同程度的损失。

      在运输鸡苗之前，一定要注意收看调运苗鸡路线沿线地区的天气预报，防止苗鸡在调运途中遇到恶劣天气，给苗鸡调运带来不便，而且恶劣天气肯定会影响苗鸡体质，影响苗鸡到场的成活率。如果遇到恶劣天气，切不可找地方躲避，而应快速赶往目的地。因为如果找地方躲避，万一恶劣天气持续时间长了，造成的损失将会更大。
      在运输鸡苗之前，要通过沿途的畜牧兽医主管部门了解沿途有没有疫区，如果有疫区，则千万不能经过，以免苗鸡通过疫区感染上疾病。因为疫区不是常有，所以这一项往往最容易被养殖场户忽视，但实际这一项是最为重要的，因为如果通过疫区时不幸被感染上疫病，那就只能全部扑杀，而且也会给当地的动物卫生防疫监督工作带来极大的麻烦，给当地的家禽业生产带来巨大的损失。同时，在运输途中，如果遇到与运输成年鸡的车辆同行时，要尽快超过运输成年鸡的车辆，不能尾随在运输成年鸡的车后边行走，更不能并排行使，以防感染上传染病。虽然遇到这样的情况不多，但也不是绝对没有。